Net indirim, fatura geneline net toplam üzerinden uygulanacak indirimdir. Fatura geneline ait bilgilerin kaydedildiği bölümde sağ fare tuşu menüsünde yer alır. Net tutara indirim uygulanacaksa "Net İndirim Uygulanacak" kutusu işaretlenir. Net indirim yüzde ya da tutar olarak yapılır. İndirim yüzde üzerinden yapılacaksa % alanında uygulanacak indirim yüzdesi belirtilir. Burada belirtilen yüzde ve net toplam tutarı dikkate alınarak hesaplanan indirim tutarı faturadaki Toplam İndirim alanına aktarılır. İndirim tutar olarak yapılıyorsa, Tutar alanında yapılacak indirim tutarı belirtilir.
Fatura indirim satırlarında F9 menüden ulaşılan Net İndirim penceresi ile satır net tutarı üzerinden iki farklı türde indirim yapılması mümkün olmaktadır.
Net İndirim 1: Net İndirim butonu işaretlendikten sonra fatura döviz türüne göre yerel para biriminden ya da işlem dövizinden girilen tutar ya da verilen oran üzerinden indirim uygulanır. Üstlenilen KDV Oranı alanına rakam girilmez. Bu durumda, satır net toplamında yapılan indirime göre KDV tutarı yeniden hesaplanır.
Net İndirim 2: Net İndirim butonu işaretlendikten sonra döviz türüne göre yerel para biriminden ya da işlem dövizinden girilen tutar/oran üzerinden indirim uygulanır. Üstlenilen KDV Oranı alanına girilen rakam, yapılan indirim üzerinden hesaplanacak KDV'nin ne kadarının satır KDV'sine ekleneceğinin hesaplanmasında kullanılır.