Logo Mind Navigator Web modülünün kullanılabilmesi için web ayarlarının yapılması gerekmektedir. Öncelikle özelliğin ayarlanabilmesi için uygulamanın kurulum dizininde yer alan Navsmartconfig.exe açılmalıdır. Ardından "Web Ayarları" sekmesinde gerekli ayarlamalar yapılmalıdır. Http veya Https olarak iki farklı seçim ile ilgili servis Url'ine bağlantı kurulabilir. İlgili alanlar ekranda girildikten sonra Kontrol Et butonuna tıklanarak girilen bilgilerin doğruluğu kontrol edilebilir.
Oturum Süresi: Bağlantı Ayarları ekranında Excel Eklentisi ve Web için tanımlanabilmektedir. Oturum Süresi alanına girilen değer 10-600 dakika arasında olmalıdır. Girilen değer, toplam oturum süresini niteler. Belirlenen oturum süresi dolduğunda uygulama oturumu sonlanacak ve kullanıcının karşısına giriş ekranı çıkacaktır. Bunun yanında uygulamada belirlenen oturum süresi boyunca bir işlem yapılmadığında da oturum süresi sonlanacak ve giriş ekranı kullanıcının tekrar giriş yapabilmesi için gösterilecektir.